18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1196 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1196  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2769  hypothetical protein  47.95 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2694  hypothetical protein  43.84 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00619156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2133  protein of unknown function DUF1271  50.67 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1024  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.51 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  45.76 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  45.76 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.61 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  34.55 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  45.16 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  45.16 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  42.42 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  40.98 
 
 		 551 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0620  hypothetical protein  46.67 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>