56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1261 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  48.44 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  51.56 
 
 
73 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  50 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  53.23 
 
 
64 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  55.38 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  55.38 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 
77 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  44.26 
 
 
66 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  51.67 
 
 
68 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  43.55 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  46.88 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  47.54 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  46.77 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  48.33 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  45.16 
 
 
64 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  48.33 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  49.18 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  44.44 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 
67 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  46.55 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  40 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  46.67 
 
 
68 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  34.92 
 
 
64 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  38.71 
 
 
66 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  34.92 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0620  hypothetical protein  45.61 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  43.55 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  43.33 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  34.92 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  34.92 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  44.26 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  47.83 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  38.33 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  44.26 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  36.51 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  40.98 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  47.5 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  38.33 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  36.51 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  41.67 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  36.67 
 
 
68 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1862  ferredoxin  34.38 
 
 
67 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0115617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  41.67 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  41.67 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  37.7 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  43.55 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  36.51 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  38.6 
 
 
599 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>