55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3681 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  138  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  45.16 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.54 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  46.67 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  41.94 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  46.77 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  41.94 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.86 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  47.54 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  47.54 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  45.9 
 
 
63 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  37.1 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  35.48 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  35.38 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  41.27 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.68 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  41.07 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.7 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  38.71 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.26 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  41.54 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  40.32 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  33.33 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  38.71 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  32.26 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  32.26 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  32.26 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  37.1 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  46.67 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5451  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.18 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  40.98 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  36.67 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 
62 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>