59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1226 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  130  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  42.62 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0766  hypothetical protein  53.03 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000279818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
505 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  43.55 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  43.55 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  43.55 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  46.03 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  42.62 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  40.98 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  45.9 
 
 
63 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  37.5 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  37.5 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  40.98 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  40.98 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  33.9 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  40.98 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  37.7 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  44.26 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.71 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  39.34 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  35.48 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  39.34 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  40.32 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5451  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  37.1 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  39.34 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  37.7 
 
 
104 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  40.98 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  40.68 
 
 
66 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  39.34 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  39.68 
 
 
70 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  41.94 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  37.7 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  42.37 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  42.37 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  42.37 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  41.94 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  39.34 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  39.34 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  38.71 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  37.7 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  41.79 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  37.7 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  34.85 
 
 
62 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>