91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3976 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  100 
 
 
64 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  54.1 
 
 
64 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  51.56 
 
 
74 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  56.45 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  43.75 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  48.39 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  45.16 
 
 
64 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  54.84 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  45.16 
 
 
73 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  43.08 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  42.62 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  45.9 
 
 
65 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  46.77 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  43.55 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  39.34 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  43.08 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  45.16 
 
 
64 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  43.55 
 
 
63 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  38.71 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  47.62 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  41.94 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  37.7 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  43.55 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  37.7 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  38.46 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  46.03 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  42.37 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  45.76 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  42.37 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  41.94 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  44.07 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  39.34 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  39.34 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  42.37 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  42.37 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  39.34 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  40.32 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  38.89 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  44.26 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  40.68 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  36.07 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  41.27 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  42.86 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  37.29 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  38.1 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  42.11 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  36.07 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  40.98 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  32.26 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3731  hypothetical protein  35.14 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  37.1 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  38.98 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.33 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  32.79 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0620  hypothetical protein  43.33 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  38.98 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  44 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1387  ferredoxin, 4Fe-4S  35.82 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000363186  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  44 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  44 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  41.07 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  34.38 
 
 
64 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  33.87 
 
 
551 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  55.56 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5451  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>