87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5381 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  100 
 
 
63 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  100 
 
 
63 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  98.31 
 
 
59 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  80 
 
 
60 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  69.84 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  65.57 
 
 
63 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5004  FdxD  66.67 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849859  normal  0.681013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4709  FdxD  65.08 
 
 
63 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4621  FdxD  65.08 
 
 
63 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  52.38 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  46.67 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  43.55 
 
 
66 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  44.07 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  44.07 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  44.07 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  44.44 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  44.07 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  42.37 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  48.44 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.67 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  40.68 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  40.68 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  38.98 
 
 
63 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  44.62 
 
 
63 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  42.19 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  48.33 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  38.71 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  45.31 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  41.67 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  45.31 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  45.31 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  39.06 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  41.94 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  41.94 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  41.27 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  44.26 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  38.33 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  38.33 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  39.68 
 
 
63 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  39.68 
 
 
63 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  39.68 
 
 
63 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  36.67 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  38.1 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  44.26 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  36.67 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  39.06 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  36.67 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  34.92 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0399  ferredoxin reductase  43.33 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  37.29 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.34 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  40.68 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  38.98 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7444  putative ferredoxin  41.94 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  42.62 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.88 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  40.68 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.79 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  39.34 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 
505 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  35.48 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  33.87 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  34.43 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  40.62 
 
 
349 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.15 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.84 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  38.33 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  36.67 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  48.39 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  38.98 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.03 
 
 
68 aa  40.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  41.94 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  41.94 
 
 
73 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>