88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1965 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 65 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  51.56 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  55 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  55 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  51.56 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  51.56 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.62 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  44.62 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  45.16 
 
 		 63 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  48.44 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  50.82 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  46.67 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  48.39 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  46.97 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  48.39 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  43.94 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  42.42 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  41.54 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  50 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  50 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  50 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  41.54 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  41.94 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  39.06 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  41.94 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  43.33 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  45.31 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  40 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  32.26 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  38.71 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  35.48 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  46.43 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  36.67 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  30.99 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  40 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  38.46 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  36.92 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  38.46 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.33 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  35.38 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  41.27 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2240  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5004  FdxD  50 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849859  normal  0.681013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  38.1 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  36.67 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  43.28 
 
 		 65 aa  42  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  41.67 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  38.46 
 
 		 66 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2248  oxoacid ferredoxin oxidoreductase  32.31 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  36.92 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  39.06 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  37.1 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  40.32 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  34.92 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  34.92 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  34.92 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  34.38 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  34.38 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  34.38 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  36.67 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  36.67 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  36.67 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  40.62 
 
 		 349 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  35 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  34.85 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.27 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  38.33 
 
 		 64 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.21 
 
 		 78 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>