57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3474 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  51.56 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  50 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  46.88 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  55.38 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  53.23 
 
 		 64 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  49.21 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  47.62 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  49.21 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  53.12 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  51.52 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  46.15 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  44.44 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  50.94 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  46.03 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  45.16 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  50.79 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  39.68 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  44.78 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  46.03 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  49.12 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  40.32 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  49.18 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  61.54 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  37.7 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  40.62 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  45.16 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  38.71 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  40.32 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  38.46 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  40.98 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  37.1 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  38.71 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  40.98 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  40.98 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  42.86 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  40.98 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  42.86 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  42.86 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  43.55 
 
 		 62 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  34.38 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0620  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  43.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  35.48 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  37.1 
 
 		 80 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 65 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>