110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1636 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  127  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  67.69 
 
 
65 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  58.46 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  53.12 
 
 
73 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  60.71 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  56.25 
 
 
63 aa  70.9  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  51.61 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  50.77 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  51.61 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  48.48 
 
 
77 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  50 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  46.67 
 
 
71 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  50.77 
 
 
65 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  46.88 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  47.69 
 
 
64 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  47.69 
 
 
64 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  60 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  42.19 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  46.88 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  45.16 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  48.39 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  46.15 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  45 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  55 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  55 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  55 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  41.27 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  46.77 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  43.08 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  45.31 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  45.16 
 
 
63 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  57.5 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  45.16 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  43.33 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  43.33 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  43.33 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  47.69 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  49.21 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  40.62 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  44.62 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  40.62 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2523  putative ferredoxin  56.45 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  45.31 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  45.31 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  45.31 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  38.71 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  43.75 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  40.32 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  45 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  47.54 
 
 
66 aa  48.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  45.16 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  41.94 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  41.94 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  39.06 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  41.94 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  42.42 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  43.33 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  43.55 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  40.32 
 
 
64 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
62 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  46.03 
 
 
67 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  39.06 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  42.19 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  38.71 
 
 
64 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  41.94 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  45.31 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  38.46 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  41.27 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  39.39 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  39.34 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  39.34 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  42.86 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  43.55 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  45.16 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  37.88 
 
 
71 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  34.85 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  39.06 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  39.06 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  39.06 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  35.94 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  33.33 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  40.32 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  37.1 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  37.1 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  38.89 
 
 
73 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  40.32 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  40.32 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  38.71 
 
 
551 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  38.71 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>