53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1479 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  100 
 
 		 71 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  45.16 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  49.21 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  41.79 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  43.55 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  39.39 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  43.94 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  37.88 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  40 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.82 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  39.68 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  38.46 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  36.07 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  36.07 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  36.07 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  38.81 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2588  hypothetical protein  38.24 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449874  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  33.85 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  36.51 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  33.8 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  38.46 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  36.92 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  35.82 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  39.39 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  34.92 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  34.85 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  33.87 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  35.38 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  31.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  33.85 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  35.38 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  37.31 
 
 		 349 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  34.85 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  35.38 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 60 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  31.82 
 
 		 64 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  39.68 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  39.34 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  29.03 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  32.31 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  31.75 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1918  hypothetical protein  38.71 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  39.71 
 
 		 65 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>