88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0638 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  100 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1918  hypothetical protein  55.93 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  51.52 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  42.37 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  42.37 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  40.68 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  41.67 
 
 		 62 aa  57  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  34.33 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  41.27 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 505 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.87 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  35.59 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  38.71 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.29 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  35.19 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  38.98 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  38.33 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.47 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  29.03 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  29.03 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  35.48 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.93 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.65 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  37.1 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  36.51 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  30.99 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  29.33 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  33.9 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  35.82 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  31.08 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2612  hypothetical protein  37.5 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000120273  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  34.43 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2422  hypothetical protein  30.49 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  34.92 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.86 
 
 		 349 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  31.15 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  35.48 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.12 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  28.57 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  28.57 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  32.47 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  35.48 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  37.1 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.21 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  28.57 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  35.48 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  31.75 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  31.67 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 62 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.12 
 
 		 62 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  38.71 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  33.33 
 
 		 63 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  38.1 
 
 		 77 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 64 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 60 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  32.26 
 
 		 63 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  28.75 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  36.84 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  30.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  28.75 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  36.92 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  37.1 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  29.03 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  36.67 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  29.23 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  30.65 
 
 		 63 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 69 aa  40  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  35.48 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  36.51 
 
 		 62 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  34.92 
 
 		 64 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>