21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2240 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  193  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  94.85 
 
 		 97 aa  185  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  72.83 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2422  hypothetical protein  69.89 
 
 		 102 aa  130  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1183  hypothetical protein  64.58 
 
 		 103 aa  122  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  60.47 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  63.1 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.32 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  34.02 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  38.03 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.44 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2133  protein of unknown function DUF1271  36.67 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2588  hypothetical protein  28 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449874  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0918  4Fe-4S ferredoxin  62.5 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0138  hypothetical protein  36.11 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0319122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  28.75 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  36.23 
 
 		 63 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  47.37 
 
 		 83 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  37.1 
 
 		 75 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>