15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2422 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2422  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  205  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  69.89 
 
 
97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  67.74 
 
 
97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  61.86 
 
 
96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1183  hypothetical protein  60.42 
 
 
103 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296724  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  52.75 
 
 
107 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  55.81 
 
 
107 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.68 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.05 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0918  4Fe-4S ferredoxin  51.35 
 
 
66 aa  44.3  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  35.06 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  30.49 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  46.51 
 
 
83 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  44.23 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>