40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0906 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 78 aa  157  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  51.95 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  52.63 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  51.32 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  48.05 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2422  hypothetical protein  48.68 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  49.35 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1183  hypothetical protein  46.05 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.53 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  41.1 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  37.84 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  37.84 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  41.1 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.26 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  32.47 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  36.49 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  58.82 
 
 		 349 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.99 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.84 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.16 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0918  4Fe-4S ferredoxin  54.05 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.99 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  58.82 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  35.53 
 
 		 61 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.99 
 
 		 62 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  36.84 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  36.84 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  37.97 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  37.97 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  37.97 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  37.66 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.79 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  28.21 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  37.1 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  37.1 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 65 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>