26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4883 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  217  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  76.19 
 
 
107 aa  169  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  62.22 
 
 
96 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  62.35 
 
 
97 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  60.47 
 
 
97 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1183  hypothetical protein  56.32 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296724  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2422  hypothetical protein  52.75 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.05 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  37.84 
 
 
349 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  31.08 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  33.8 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  33.8 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.81 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  32.39 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  50 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  34.72 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.33 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  32.47 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  38.67 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  48.57 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  34.67 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.33 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0918  4Fe-4S ferredoxin  46.15 
 
 
66 aa  40.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  33.77 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  50 
 
 
63 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  50 
 
 
63 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>