20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2631 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  76.19 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  56.47 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2357  hypothetical protein  64.29 
 
 		 97 aa  97.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.107773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  63.1 
 
 		 97 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2422  hypothetical protein  55.81 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1183  hypothetical protein  55.29 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0906  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.95 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.181195  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  40 
 
 		 349 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.67 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0918  4Fe-4S ferredoxin  53.85 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  33.75 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  33.8 
 
 		 62 aa  42  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  38.67 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  32.47 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  50 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.8 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>