59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1933 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  100 
 
 		 75 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  85.07 
 
 		 69 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  85.07 
 
 		 69 aa  120  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  76.12 
 
 		 69 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  44.44 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  46.27 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  42.19 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  40.98 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  42.62 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  39.39 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  42.62 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  40.98 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  42.62 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  40.98 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  40.98 
 
 		 104 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.62 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  43.33 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  35.71 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  40.62 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  40.98 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  38.81 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  43.33 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  44.62 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  39.34 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  29.33 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  38.1 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  37.68 
 
 		 551 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  38.1 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  39.68 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  41.18 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2631  hypothetical protein  33.75 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338821  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  36.67 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  34.92 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  32.81 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0918  4Fe-4S ferredoxin  38.1 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  32.81 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  33.87 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  36.92 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  33.87 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  34.33 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  34.38 
 
 		 63 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  32.47 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1918  hypothetical protein  36.21 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2240  hypothetical protein  37.1 
 
 		 97 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.295643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>