62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2484 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  211  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  91.09 
 
 
101 aa  191  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  69.74 
 
 
104 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  69.74 
 
 
104 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  69.74 
 
 
104 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  45 
 
 
60 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.33 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.33 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.33 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  37.5 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  39.06 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  44.62 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  41.67 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  38.33 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  40 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  41.54 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  38.33 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  39.06 
 
 
69 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7444  putative ferredoxin  38.33 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  40 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  40 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  37.5 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  35 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  37.29 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  37.7 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  37.29 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  37.29 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  38.33 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  38.33 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  40.98 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.92 
 
 
68 aa  44.3  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  36.51 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  39.34 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1470  hypothetical protein  43.59 
 
 
96 aa  44.3  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000196501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  43.75 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  39.34 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  39.66 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  38.33 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  38.98 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  37.7 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  33.33 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  37.5 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  33.33 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  38.1 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  33.33 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  38.33 
 
 
64 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  33.33 
 
 
81 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  35.59 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  36.51 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  36.51 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  36.07 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  35.59 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  41.18 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  35.59 
 
 
505 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  30 
 
 
65 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  30 
 
 
65 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1619  ferredoxin  34.38 
 
 
70 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466459  normal  0.186197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  30 
 
 
65 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>