11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1619 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1619  ferredoxin  100 
 
 		 70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466459  normal  0.186197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  49.18 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 		 505 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  42.19 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  35.94 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  44.07 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  38.71 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7444  putative ferredoxin  43.55 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  36.51 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>