52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4214 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  43.75 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5451  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  40.68 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  39.34 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  41.94 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  40.68 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  37.7 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  40.98 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  40.98 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  40.98 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.98 
 
 		 349 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  43.1 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  44.26 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  41.38 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  38.98 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  41.38 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  40.98 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  38.98 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  34.43 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  39.66 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  33.96 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  45 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0650  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.31 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000524122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  38.71 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 60 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  44.26 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  39.66 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  38.98 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  38.98 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  39.34 
 
 		 64 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  34.48 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  34.48 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.31 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  41.27 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  31.58 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  36.67 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  42.86 
 
 		 62 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>