69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3842 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 		 65 aa  133  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  56.92 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  57.81 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  59.68 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  59.68 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  59.68 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  58.06 
 
 		 71 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  47.62 
 
 		 63 aa  62  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  45.16 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  43.55 
 
 		 551 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  40 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  45.31 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  37.5 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  45.16 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  39.39 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  46.03 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  45.9 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  45 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  41.38 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  42.19 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  45.16 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  37.93 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  37.93 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  44.44 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  44.44 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  44.44 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  41.27 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  45.9 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  37.1 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  39.66 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  44.26 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  37.7 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  40.32 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  37.7 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  37.7 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  37.7 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0399  ferredoxin reductase  38.33 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  40.91 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  39.71 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  39.71 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  44.26 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  31.67 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  39.39 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  37.1 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  40.58 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  34.92 
 
 		 65 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  41.94 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  42.11 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  38.71 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  38.71 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  38.46 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  36.92 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.76 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  33.9 
 
 		 65 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.07 
 
 		 60 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>