82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2802 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  52.38 
 
 
63 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  49.18 
 
 
63 aa  66.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  45.31 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  47.54 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  47.54 
 
 
62 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  42.86 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  42.86 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  42.86 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  44.44 
 
 
63 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  38.1 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  47.69 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  40.62 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  39.68 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  39.68 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  41.67 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  44.44 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  41.54 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  40 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  40 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  37.5 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  45.9 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8253  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  decreased coverage  0.00829105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  37.1 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  39.06 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  35.94 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  36.92 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  42.86 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.5 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.68 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  42.37 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  41.54 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  36.51 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  33.87 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.1 
 
 
349 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  37.1 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  34.43 
 
 
551 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  40.32 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  40.32 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  40.32 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  38.71 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  41.27 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  37.1 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  41.54 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.28 
 
 
65 aa  42  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  34.92 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  40.32 
 
 
65 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  36.67 
 
 
62 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  36.51 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.33 
 
 
60 aa  41.2  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  37.1 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  35.48 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  35.48 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  36.51 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  35.94 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  37.29 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  38.46 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  37.29 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  37.1 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.9 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  35.59 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  38.46 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  35.94 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  34.92 
 
 
63 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  36.51 
 
 
67 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  36.51 
 
 
67 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  36.51 
 
 
67 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>