100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0009 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  85.48 
 
 
64 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  85.48 
 
 
64 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  85.48 
 
 
64 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  46.03 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  42.19 
 
 
62 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  48.33 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  41.94 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  43.75 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  43.55 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  41.94 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  45.31 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  46.77 
 
 
65 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  44.26 
 
 
67 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  42.19 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  44.26 
 
 
67 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  44.26 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  46.67 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  43.55 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  44.26 
 
 
67 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  48.21 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  43.55 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  42.19 
 
 
63 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  42.19 
 
 
63 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  42.19 
 
 
63 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0399  ferredoxin reductase  40.32 
 
 
71 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  36.51 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  45.31 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  38.71 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  41.94 
 
 
62 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  39.68 
 
 
68 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  40.32 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  43.33 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  46.03 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  45 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  44.62 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  40.32 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  43.75 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  43.75 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  38.71 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  43.33 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  43.75 
 
 
63 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  40.62 
 
 
63 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  41.27 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  43.33 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  41.27 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  43.75 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  35.48 
 
 
65 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  39.06 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  43.75 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  43.28 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  38.1 
 
 
551 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  35.48 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  41.67 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  36.67 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  36.67 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  33.8 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  37.7 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  39.34 
 
 
505 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  37.7 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  38.33 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.32 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  36.67 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  38.33 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  37.7 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  32.81 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  41.27 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  40.32 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  42 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  45 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  37.1 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  41.67 
 
 
83 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  36.67 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  37.5 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  34.43 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5451  hypothetical protein  34.43 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  34.43 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  34.43 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  34.43 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  34.43 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  34.43 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  41.67 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  35.48 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  38.71 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  38.46 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  37.1 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  37.1 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  34.43 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  36.51 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>