38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0944 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  100 
 
 		 81 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  51.61 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  46.77 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  50 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  48.39 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  48.33 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  45.16 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  43.66 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  45.61 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  48.39 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  48.39 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  48.39 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  49.12 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  48.39 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  43.64 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  45.16 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  42.86 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  46.77 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  45.61 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  38.89 
 
 		 551 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  45.45 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  48.39 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2117  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  51.28 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000643855  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  43.86 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  46.77 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2523  putative ferredoxin  45 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  37.7 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  37.7 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  38.71 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  37.7 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  35.21 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  38.71 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  36.67 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>