83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4935 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  100 
 
 		 65 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  60.94 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  57.14 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  56.45 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  54.84 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  56.45 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  51.61 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  60.34 
 
 		 66 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  64.52 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  64.52 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  64.52 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  50 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  56.45 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  51.61 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  46.77 
 
 		 77 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  48.39 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  49.21 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  48.39 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  48.39 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  51.56 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  51.56 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  42.86 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  62.79 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  46.77 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  47.62 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  46.77 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  43.55 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  47.62 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  48.33 
 
 		 81 aa  57  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  54 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  41.94 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  43.55 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  39.68 
 
 		 551 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  41.94 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  41.94 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  45.16 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  35.48 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  38.71 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  38.1 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.67 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  40.32 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  39.68 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  37.1 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  37.1 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  38.81 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  35.48 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  48.28 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  34.92 
 
 		 65 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.62 
 
 		 68 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  38.71 
 
 		 62 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  41.67 
 
 		 63 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  40.32 
 
 		 65 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2133  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 		 78 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  39.06 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  38.1 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  37.1 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  43.55 
 
 		 349 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  33.77 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  39.34 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.71 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  31.75 
 
 		 69 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>