73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4168 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  100 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  52.38 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  46.03 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  46.03 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  46.77 
 
 
63 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  46.03 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  46.77 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  48.39 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  48.21 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  43.55 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  44.44 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  41.94 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  37.1 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  39.34 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  41.94 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  37.1 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  40.32 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  39.68 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  37.1 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  37.1 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  41.94 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  41.94 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  45.16 
 
 
77 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  33.33 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  39.34 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  35.48 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  35.48 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  35.48 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  38.1 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  40.32 
 
 
66 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  34.43 
 
 
63 aa  47  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  37.1 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  37.29 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  40.32 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  35.48 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  40.98 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  42.86 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  36.07 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  36.51 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  32.79 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  36.07 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  38.71 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  37.1 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  37.1 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  32.79 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  41.67 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  41.67 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  36.07 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  42.86 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  35.48 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  42.86 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  42.86 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  34.43 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  40 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  40.98 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  32.26 
 
 
551 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  37.1 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.1 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  31.15 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2523  putative ferredoxin  48.39 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  35.48 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  32.2 
 
 
61 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1051  ferredoxin  37.14 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.515037  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.65 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  38.71 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.51 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>