137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1256 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  129  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  49.21 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  46.03 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  45.31 
 
 		 65 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  44.44 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  40.98 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  40.98 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  40.98 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  42.19 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  45.31 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  38.1 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  38.1 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  39.68 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  38.1 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  37.7 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  41.27 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  36.51 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  42.19 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  39.68 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  42.62 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  39.68 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  45.31 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  36.51 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  40.62 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.26 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  34.38 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  42.86 
 
 		 349 aa  50.4  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 60 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  39.68 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  43.86 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  34.92 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  36.51 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  36.51 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  32.26 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  36.51 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  36.07 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  42.86 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  36.51 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  39.68 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  38.33 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  38.33 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  38.33 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  41.67 
 
 		 551 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  44.07 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  44.07 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  40.68 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  37.7 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  37.7 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  38.1 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  34.92 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  34.92 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.75 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  40.62 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.33 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  42.37 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  46.88 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  39.34 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.71 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  35.48 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  35.48 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  33.33 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  38.46 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1625  ferredoxin family protein, putative  42.11 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.216587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  34.38 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  34.92 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  36.07 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  36.36 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  39.06 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  34.43 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  44.64 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  34.92 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  33.87 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  35 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  42.37 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  30.77 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  34.92 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>