26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4246 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  32.81 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  36.36 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  38.1 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  38.1 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  41.54 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.38 
 
 
349 aa  42.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  34.38 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  34.43 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  34.43 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  34.43 
 
 
66 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  35.94 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  35.94 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  35.94 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  36.92 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  35.38 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  35.94 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  38.1 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  33.87 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
62 aa  40  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  31.75 
 
 
65 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>