86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1634 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  55.56 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  54.1 
 
 		 63 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  66.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  46.03 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  46.03 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  50.79 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  46.03 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  46.77 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  47.54 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  47.54 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  47.54 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  45.9 
 
 		 62 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  44.44 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  50.82 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  47.54 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  43.75 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  52.46 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  48.44 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  48.44 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  48.44 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  54.1 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  46.03 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  45.9 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8253  hypothetical protein  48.44 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  decreased coverage  0.00829105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  39.34 
 
 		 551 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  37.7 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  45.16 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  35.48 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  34.43 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  36.07 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  43.55 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  43.33 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  35.48 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  35.48 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  43.28 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  32.79 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  34.92 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  40.62 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  35 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.08 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  38.98 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  38.98 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  45.16 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  39.06 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  38.71 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  45 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  37.7 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  32.81 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  40.98 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  33.87 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  38.1 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  33.87 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  41.54 
 
 		 64 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  35.48 
 
 		 64 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  40.98 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  40 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  38.46 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  38.46 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  38.46 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  34.43 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  37.31 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  36.07 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  29.69 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  29.51 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  34.92 
 
 		 63 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  34.92 
 
 		 63 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  37.1 
 
 		 63 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>