58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2133 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  56.25 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  50.79 
 
 
62 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  46.88 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  46.88 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  46.88 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  45.31 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  46.15 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  39.06 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  39.06 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  39.06 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  39.68 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  39.68 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  39.68 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.43 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  38.46 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  42.62 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  43.33 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8253  hypothetical protein  51.56 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  decreased coverage  0.00829105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  36.23 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  36.23 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  36.23 
 
 
65 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7444  putative ferredoxin  49.21 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  31.82 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  38.33 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  40.62 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.07 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  40.62 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  39.06 
 
 
64 aa  42  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  35.94 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  35.94 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  35.94 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  32.81 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  40.32 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  38.33 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  35.94 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  38.33 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  38.33 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  29.51 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  35.94 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  35.94 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  36.07 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  39.68 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  39.68 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  39.06 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  36.51 
 
 
71 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.81 
 
 
68 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.81 
 
 
68 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.81 
 
 
68 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  35.94 
 
 
349 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>