85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2877 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  72.58 
 
 		 63 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  55.74 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  51.67 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  51.67 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  51.67 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8253  hypothetical protein  77.42 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  decreased coverage  0.00829105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  48.39 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  44.26 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  45.9 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  50.79 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  47.54 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  50.79 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  39.34 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  40 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.1 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  37.1 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  38.71 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.9 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  32.79 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  38.71 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  38.71 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.68 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  41.94 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  40.32 
 
 		 349 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  36.67 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  35.48 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  35.48 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  43.55 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  33.33 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  37.93 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  38.33 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  33.33 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  40.32 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  40 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  40 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  38.1 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  38.33 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  37.1 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  38.71 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  33.87 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  39.34 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  33.87 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  32.26 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  31.15 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  34.92 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  33.87 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  31.15 
 
 		 551 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  36.07 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  29.51 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  33.9 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  35.48 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  31.67 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  31.67 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  31.67 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  35.48 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1918  hypothetical protein  35.48 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>