101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2015 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  100 
 
 		 63 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  100 
 
 		 63 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  100 
 
 		 63 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  79.03 
 
 		 64 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  80.33 
 
 		 64 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  42.62 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  44.26 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  44.07 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  42.62 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  36.07 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  36.51 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  42.37 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  42.37 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  42.37 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  39.06 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  36.51 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  42.59 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  37.1 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  36.51 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  40.68 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  44.44 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  41.27 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  43.55 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  43.55 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.92 
 
 		 349 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  38.1 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  39.68 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  39.68 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  36.07 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  39.68 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  39.34 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  37.29 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  37.29 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.07 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5451  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  34.43 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  34.43 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  37.1 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  37.1 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  35.94 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  30 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  35.94 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  30 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  40.62 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  35.94 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  30 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  40.32 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  35.59 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  40 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0766  hypothetical protein  41.27 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000279818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  39.06 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  37.7 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  36.07 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  37.29 
 
 		 60 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 64 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  35.59 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  41.54 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  36.67 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  35.59 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  36.67 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  36.67 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  38.1 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  27.42 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  35 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  31.75 
 
 		 64 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>