69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3163 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  46.67 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  40 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  49.3 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  43.33 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  41.67 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  42.37 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  37.7 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  38.98 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  39.06 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  39.66 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0620  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  39.66 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  38.33 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  39.66 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  44.44 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  39.34 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  36.21 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.07 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  35.94 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  37.1 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  37.1 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  37.93 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  37.29 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  38.98 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  36.36 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  37.7 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  44.26 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  42.37 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  33.33 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  38.33 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  33.87 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  38.6 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  36.67 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  36.84 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  39.34 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  36.84 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  35 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  36.54 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  35.82 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  35 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  43.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  34.43 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  40 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  33.87 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  40 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  36.07 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 		 505 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  40 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  33.33 
 
 		 551 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  34.43 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  45.24 
 
 		 66 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  35 
 
 		 64 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 61 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  41.51 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  35 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  35.82 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>