46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3878 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  73.85 
 
 		 70 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  68.12 
 
 		 71 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  67.8 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  67.8 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  66.1 
 
 		 71 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  67.21 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  58.62 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  55 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0399  ferredoxin reductase  51.56 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  32.79 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  40.91 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  44.26 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  43.55 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  39.34 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  34.43 
 
 		 62 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  34.92 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  38.1 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  30 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  33.87 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  36.51 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  35.82 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  33.87 
 
 		 65 aa  43.5  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  34.38 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  34.92 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  39.06 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  34.43 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  31.67 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  36.07 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  34.92 
 
 		 65 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  35.48 
 
 		 63 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  29.03 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  37.7 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  28.79 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>