114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  100 
 
 		 65 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  64.62 
 
 		 66 aa  93.6  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  66.15 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  67.69 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  76.79 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  57.81 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  51.56 
 
 		 73 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  58.46 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  56.45 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  64.62 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  54.84 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  51.56 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  49.23 
 
 		 77 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  53.12 
 
 		 64 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  56.25 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  50 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  52.31 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  52.31 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  50.77 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  45.31 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  47.69 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  53.12 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  51.56 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  43.33 
 
 		 71 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  46.77 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  45.31 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  50 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  45.31 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  46.77 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  46.55 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  44.62 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  45.31 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  60 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  60 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  60 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  43.75 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  43.94 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  41.54 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  43.55 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  43.75 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  38.71 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  45.16 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  43.55 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  43.55 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  42.19 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  45.9 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  44.78 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  45 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  45 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  38.46 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  46.67 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  43.33 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  43.08 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  42.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  41.27 
 
 		 551 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  39.06 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  39.06 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  42.62 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  39.06 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  40.62 
 
 		 349 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  46.77 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  45 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  42.19 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  42.19 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  42.19 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  41.54 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2523  putative ferredoxin  51.61 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  45.76 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  37.1 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  43.08 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  42.62 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.08 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  42.62 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  35.94 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  43.55 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  42.19 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  38.71 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  38.71 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  37.1 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>