92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6843 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  46.77 
 
 
62 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  48.33 
 
 
62 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  50.85 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  50.85 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  48.44 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  49.15 
 
 
63 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  46.27 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  45.9 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  44.44 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  44.44 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  44.83 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  43.75 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  48.39 
 
 
63 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  42.42 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.39 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  39.34 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  44.26 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  44.26 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  44.26 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  43.75 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  45 
 
 
60 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  41.79 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  42.37 
 
 
59 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  41.94 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  42.37 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.68 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  38.33 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  41.27 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  34.43 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  40.98 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  40.98 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  42.86 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.1 
 
 
349 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.67 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  41.94 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  43.55 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  33.33 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  38.71 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  41.67 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.92 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  38.1 
 
 
63 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.98 
 
 
62 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  43.55 
 
 
551 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  40.98 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  39.06 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  40.62 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  35 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  30.16 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  43.55 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  34.43 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  40.62 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  34.92 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  40.32 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5004  FdxD  42.86 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849859  normal  0.681013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  33.9 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4709  FdxD  41.27 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 
60 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4621  FdxD  41.27 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  38.71 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  38.71 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  33.33 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7444  putative ferredoxin  36.07 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  38.71 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  36.92 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.59 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1918  hypothetical protein  37.1 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  33.87 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1017  ferredoxin  36.62 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.194367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  33.33 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  31.75 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  37.29 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>