64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7444 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7444  putative ferredoxin  100 
 
 
65 aa  130  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  43.33 
 
 
505 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  39.06 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  49.21 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3704  hypothetical protein  38.33 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.623768  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  38.33 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  38.33 
 
 
104 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  38.33 
 
 
104 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  45.76 
 
 
63 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  38.33 
 
 
101 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  49.15 
 
 
62 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  45.76 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  45.76 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  41.67 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
68 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
68 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  38.71 
 
 
68 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  45.76 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 
62 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  41.27 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  40.32 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  39.34 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  41.94 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  41.94 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  39.68 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  40.98 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  43.75 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  40.32 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  37.7 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  40.32 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  38.33 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  38.33 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  38.33 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  41.94 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  36.07 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  45.76 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  43.55 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1619  ferredoxin  43.55 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466459  normal  0.186197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  42.37 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  39.34 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.71 
 
 
349 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  36.51 
 
 
65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
62 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  36.51 
 
 
65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  36.51 
 
 
65 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  39.68 
 
 
63 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  37.31 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  33.33 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  36.07 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  36.07 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  36.07 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4621  FdxD  47.46 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4709  FdxD  47.46 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>