95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1600 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  100 
 
 		 74 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  55.74 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  52.17 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  55.74 
 
 		 64 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  51.56 
 
 		 64 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  56.92 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  50.79 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  58.06 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  58.06 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  60.32 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  46.03 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  46.88 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  49.23 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  49.23 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  44.26 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  45.31 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  44.26 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  57.38 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.33 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  40.98 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  40.98 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  46.77 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  42.86 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  43.55 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  44.26 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  45.9 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  46.77 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  42.86 
 
 		 63 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  42.86 
 
 		 63 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  45.31 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  41.54 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  41.27 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  54 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  34.92 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  45 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  42.37 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  36.07 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  36.51 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  44.26 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  41.27 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.26 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  36.07 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  37.1 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  38.71 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  45.1 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  44 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  44 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  44 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  42.37 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  37.1 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  37.7 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  41.94 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  37.29 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  32.79 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.93 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  38.71 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  33.82 
 
 		 599 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  37.7 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  32.81 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  39.34 
 
 		 63 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  30.51 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  37.7 
 
 		 64 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.42 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  37.7 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  35.48 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  37.7 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  36.07 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  34.38 
 
 		 349 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0620  hypothetical protein  42.62 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  28.57 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  28.57 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  28.57 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  35.38 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4246  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  31.75 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  35.82 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 505 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1862  ferredoxin  32.35 
 
 		 67 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0115617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>