66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1338 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  73.53 
 
 
68 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  61.54 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  61.54 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  54.55 
 
 
73 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  54.69 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  54.84 
 
 
64 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  49.18 
 
 
64 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  43.75 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  50.79 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  51.56 
 
 
64 aa  62  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  48.39 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  59.02 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  50.77 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  46.15 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  53.12 
 
 
68 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  47.69 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  45.31 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  41.27 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  41.27 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  47.54 
 
 
65 aa  57  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  44.44 
 
 
63 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  41.54 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  51.67 
 
 
64 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  43.08 
 
 
66 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  39.68 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  42.19 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  39.68 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  39.06 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  34.92 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  36.07 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  40.32 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  44.64 
 
 
66 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  38.1 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  38.1 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  38.1 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.68 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  44.9 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  38.1 
 
 
349 aa  44.3  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  36.54 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  44.83 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  34.92 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  46.15 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  44 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  44 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  32.79 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  44 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  41.54 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  41.27 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  37.1 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  36.07 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  36.07 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  33.33 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.51 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1862  ferredoxin  37.5 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0115617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  39.68 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  36.51 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2133  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  29.69 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  28.57 
 
 
63 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>