92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5330 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  100 
 
 
66 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  81.82 
 
 
66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  64.62 
 
 
65 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  66.07 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  63.64 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  51.56 
 
 
73 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  59.38 
 
 
64 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  55.38 
 
 
77 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  53.97 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  50.79 
 
 
64 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  53.12 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  53.85 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  56.25 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  54.69 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  48.44 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  46.88 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  48.44 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  47.69 
 
 
68 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  49.23 
 
 
74 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  46.88 
 
 
63 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3780  putative ferredoxin  57.81 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3768  putative ferredoxin  57.81 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3841  putative ferredoxin  57.81 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  54.69 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  48.39 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  51.56 
 
 
68 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  46.15 
 
 
68 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  43.75 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  46.97 
 
 
64 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  46.77 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  46.97 
 
 
64 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  44.62 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  47.76 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  43.33 
 
 
65 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  38.71 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  44.62 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  39.34 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  34.92 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  46.15 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  43.75 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  46.15 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  46.15 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  43.75 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  41.94 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  40.32 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  46.03 
 
 
62 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  47.54 
 
 
66 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  43.28 
 
 
349 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  38.71 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2586  protein of unknown function DUF1271  41.54 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  40.62 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  43.33 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  41.94 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  41.94 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  43.33 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  37.1 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  40.32 
 
 
62 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  45.31 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  43.75 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  42.19 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  41.67 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  38.46 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  45 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.94 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  39.06 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.31 
 
 
60 aa  42.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  31.82 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  41.67 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  36.92 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  35.48 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2523  putative ferredoxin  44.44 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  36.92 
 
 
67 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  36.92 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  47.62 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  38.1 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  36.92 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.54 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  36.92 
 
 
65 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  45.16 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  35.94 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  36.36 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  33.85 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  37.88 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  40.62 
 
 
63 aa  40  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.7 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>