89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1038 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 
65 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  52.46 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  52.46 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  55.56 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  50.79 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  49.18 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  46.15 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  43.75 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  46.88 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  50 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  51.56 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  45.9 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  45.31 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  50 
 
 
65 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  44.44 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  48.44 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  48.44 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  42.86 
 
 
349 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  46.03 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  45.9 
 
 
74 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  43.94 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  40.32 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  40.32 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  46.15 
 
 
66 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  44.26 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1960  protein of unknown function DUF1271  51.72 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0271594  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  41.27 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  48.33 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  42.62 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  45.76 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  45.76 
 
 
66 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  40 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5451  hypothetical protein  45.61 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  45.61 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  45.61 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  45.61 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  46.43 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  45.61 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  45.61 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  45.61 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  38.81 
 
 
71 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2729  protein of unknown function DUF1271  43.33 
 
 
67 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.295977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  40.62 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  40.32 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  38.98 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1918  hypothetical protein  40.98 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  40.62 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  34.38 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  43.86 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  45.45 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  40.62 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.1 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  32.26 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  32.26 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  32.26 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  36.07 
 
 
64 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  34.92 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5330  putative ferredoxin  48.89 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  32.79 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  36.07 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  32.79 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  36.07 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  36.07 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  32.79 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.67 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  39.68 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  40.62 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  32.39 
 
 
73 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  37.1 
 
 
67 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4429  putative ferredoxin  39.06 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  41.51 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  37.1 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  31.25 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  32.26 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3691  hypothetical protein  38.81 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0923  hypothetical protein  27.42 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3764  hypothetical protein  38.81 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.310706  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  33.33 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4473  hypothetical protein  32.89 
 
 
96 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.117975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>