34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5848 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5451  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  98.46 
 
 
65 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  98.46 
 
 
65 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  63.33 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  57.38 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  57.38 
 
 
66 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  45.76 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  44.07 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  42.62 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  42.62 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  44.07 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  45.61 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  45 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  36.84 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  37.29 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  37.29 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  37.29 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  42.62 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  35.09 
 
 
68 aa  42  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  41.67 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  34.43 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  42.19 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  35.09 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  37.29 
 
 
64 aa  40  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>