67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1736 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  100 
 
 
62 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  67.21 
 
 
62 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  67.74 
 
 
62 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  54.84 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  46.48 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  51.67 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  45.9 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  44.83 
 
 
73 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  44.83 
 
 
73 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  44.83 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0399  ferredoxin reductase  47.54 
 
 
71 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  45.16 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  42.62 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  40.32 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  40.98 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  42.19 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  44.44 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  41.67 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  41.67 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  41.67 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  36.51 
 
 
64 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  38.33 
 
 
68 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  41.94 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  34.43 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  44.62 
 
 
64 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  38.33 
 
 
551 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  42.19 
 
 
64 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  37.5 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  42.19 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  44.64 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  37.1 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  37.1 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  37.1 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  34.92 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22770  ferredoxin  41.27 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.787982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  34.43 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  35.38 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  46.43 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  41.54 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  41.54 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  35.48 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  41.54 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  40.91 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  34.92 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  29.03 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  40.98 
 
 
63 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  36.51 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  39.68 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  39.68 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.07 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  36.92 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  31.75 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  33.33 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  33.33 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  38.71 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  34.85 
 
 
64 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  33.33 
 
 
63 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>