88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1275 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  47.62 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  46.03 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  46.03 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  55 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  55 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  53.33 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.16 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  48.39 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  42.86 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  43.55 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  46.77 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4427  protein of unknown function DUF1271  45.16 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.119143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  46.03 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  45.9 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  39.68 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.27 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  41.27 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  44.44 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  46.88 
 
 		 349 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  36.51 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4935  putative ferredoxin  35.48 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  43.55 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  38.71 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  37.88 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4235  putative ferredoxin  42.86 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  40.32 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  38.71 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  36.51 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 60 aa  48.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  43.33 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  40.32 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  43.55 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  41.94 
 
 		 551 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  36.07 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  39.68 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  39.68 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  41.94 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  45.16 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  40.91 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  31.43 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  41.94 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  35.48 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.1 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  40.62 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  39.06 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  35.48 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  41.27 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  40 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  37.7 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  40.32 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  38.71 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  31.75 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  36.51 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  41.38 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  37.1 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4883  hypothetical protein  38.67 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190233  normal  0.299907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  34.92 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2417  putative ferredoxin  42.86 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0533344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.1 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  36.92 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.33 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0944  putative ferredoxin  36.67 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  37.1 
 
 		 64 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>