52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4176 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  84.62 
 
 
66 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  77.78 
 
 
66 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  77.78 
 
 
66 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  77.78 
 
 
66 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  70.1  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  50 
 
 
63 aa  67  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  66.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  51.67 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  51.67 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  51.67 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  43.33 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  43.33 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  47.46 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  44.07 
 
 
63 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  44.07 
 
 
63 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  38.98 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  44.64 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  42.37 
 
 
60 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  43.33 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  41.94 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  33.33 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  39.68 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.67 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.67 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8253  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  decreased coverage  0.00829105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  36.07 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.38 
 
 
62 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  37.7 
 
 
551 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  35.48 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  33.33 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  36.54 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5004  FdxD  41.94 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849859  normal  0.681013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  37.1 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  37.29 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  39.34 
 
 
64 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  33.85 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  33.85 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  33.85 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  37.1 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  29.51 
 
 
505 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4621  FdxD  38.71 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  39.34 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4709  FdxD  38.71 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  30.51 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  31.75 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.48 
 
 
62 aa  40  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>