125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3954 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3954  protein of unknown function DUF1271  100 
 
 		 64 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  52.38 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  52.38 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  52.38 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  57.63 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  48.33 
 
 		 66 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  52.38 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  47.62 
 
 		 63 aa  70.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  48.44 
 
 		 64 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  50 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  42.86 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5381  FdxD  48.33 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  43.33 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5671  FdxD  48.33 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.856252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3662  putative ferredoxin  46.03 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  40.32 
 
 		 62 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5292  FdxD  49.09 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.887025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0529  putative ferredoxin  47.54 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0507  putative ferredoxin  47.54 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.793827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5004  FdxD  56.67 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849859  normal  0.681013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  40 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  47.69 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  36.07 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1600  putative ferredoxin  42.19 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3976  putative ferredoxin  39.06 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  41.27 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  33.87 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4621  FdxD  55 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4366  hypothetical protein  44.26 
 
 		 66 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0924062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  33.87 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4709  FdxD  55 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  33.87 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8253  hypothetical protein  48.44 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.960362  decreased coverage  0.00829105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.98 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  38.1 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2133  hypothetical protein  42.19 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  37.29 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  37.29 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0681  putative ferredoxin  41.94 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  37.29 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  38.1 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  41.54 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  34.92 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  32.81 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5451  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5646  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5848  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00304869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1697  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0532  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.805875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1646  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0551  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  38.71 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  34.43 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  33.87 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  33.87 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  34.43 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  32.2 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  34.43 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1261  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 62 aa  49.7  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  34.43 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  34.43 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.79 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4344  putative ferredoxin  37.29 
 
 		 65 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  32.81 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  42.62 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  33.85 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.59 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  33.85 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  33.85 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2484  hypothetical protein  38.33 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  38.71 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  37.1 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4170  hypothetical protein  38.33 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  38.46 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  36.92 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  35.94 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  36.92 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  39.06 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.98 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  33.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  38.46 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4202  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0165  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.501919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  32.79 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>