44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11816 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11816  ferredoxin  100 
 
 		 67 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.454511  normal  0.975573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4098  hypothetical protein  81.25 
 
 		 64 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4586  hypothetical protein  43.55 
 
 		 62 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  41.54 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  41.54 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  41.54 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  45 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  45 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  45 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  34.43 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  39.68 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4159  hypothetical protein  39.06 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  37.29 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  37.31 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3242  putative ferredoxin  40.68 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2499  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  37.5 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  38.1 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  36.92 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  35.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.33 
 
 		 349 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4034  putative ferredoxin  34.92 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1552  hypothetical protein  36.67 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  32.81 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  36.36 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2537  hypothetical protein  35.82 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605386  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1953  protein of unknown function DUF1271  34.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  30.77 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.85 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5849  FdxD  35.59 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98386 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3474  hypothetical protein  35.48 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00539266  hitchhiker  0.00542326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13537  ferredoxin fdxD  32.2 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.48492  hitchhiker  0.0000142713 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  33.33 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4202  ferredoxin  32.39 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0571776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  32.79 
 
 		 63 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  32.79 
 
 		 63 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  32.79 
 
 		 63 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>