49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1553 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 61 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  49.15 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0650  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  52.46 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000524122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  49.15 
 
 		 349 aa  57  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.55 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  50.85 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  50 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  50.85 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  48.33 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.33 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  49.15 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.07 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.76 
 
 		 68 aa  49.7  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.15 
 
 		 60 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.33 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  45.76 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  45.76 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  41.07 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.07 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  36.07 
 
 		 62 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  37.74 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.59 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0923  hypothetical protein  33.87 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954021  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  35.59 
 
 		 62 aa  44.3  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.27 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2544  putative ferredoxin  42.62 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.88743e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  42.11 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  38.46 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.31 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  44.07 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0638  ferredoxin  36.21 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.703717  normal  0.051858 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1862  ferredoxin  38.33 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0115617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2655  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 61 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  40.74 
 
 		 71 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.35 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  40.35 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45684  predicted protein  37.5 
 
 		 561 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3494  putative ferredoxin  34.48 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2229  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.1 
 
 		 56 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000195937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  36.07 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>