53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0546 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 63 aa  124  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  48.39 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  48.39 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  44.44 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.46 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 62 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 60 aa  57  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  48.39 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.16 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.76 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2566  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.77 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3187  ferredoxin family protein  45.76 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0650  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  48.39 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000524122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  46.03 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0429  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00643202  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1553  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.1 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.26 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3492  ferredoxin family protein, putative  49.09 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.59 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.31 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0198  ferredoxin family protein, putative  46.77 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  33.33 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3088  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.66 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  40.68 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0148  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  48.28 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  40.68 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1186  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  39.66 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.627413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1365  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  47.46 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  38.98 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0129  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91407  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1503  hypothetical protein  33.78 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3764  ferredoxin  32.31 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2919  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  47.46 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.74825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  38.98 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3449  ferredoxin family protein, putative  44.83 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  34.55 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  30.65 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  35.48 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  35.48 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3697  ferredoxin family protein, putative  40.98 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  35.48 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0549  ferredoxin  33.87 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  38.98 
 
 		 66 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>