43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2977 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2977  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
60 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0154  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  62.71 
 
 
63 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1814  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  54.55 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2676  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.17 
 
 
64 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0286  ferredoxin II  55.36 
 
 
64 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0002  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  45 
 
 
349 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  58.33 
 
 
60 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1853  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 
60 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.33 
 
 
60 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000490188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.15 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.86 
 
 
60 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.00000000942879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0169  ferredoxin  48.33 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.925879 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1295  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.32 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000405521  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.55 
 
 
59 aa  47.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.27215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0705  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.28 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.11788  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 
68 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1080  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00122069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3343  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000237293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0952692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3023  ferredoxin  50 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.667547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2203  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.62 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0546  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.94 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1832  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.43 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140208  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.33 
 
 
58 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.43 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.915764  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3170  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  45.61 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000199396  normal  0.668845 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.35 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45.9 
 
 
57 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2520  ferredoxin  43.55 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2834  ferredoxin  43.55 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0967  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.37 
 
 
395 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2497  hypothetical protein  39.29 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000099072  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1007  ferredoxin  38.6 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16671  hypothetical protein  36.21 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18761  hypothetical protein  38.6 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1503  hypothetical protein  36.62 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  41.67 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2117  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  39.13 
 
 
76 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000643855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1637  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.67 
 
 
62 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0090194  hitchhiker  0.00634424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1714  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
395 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>